樣品瓶有三種瓶蓋類型：鉗口蓋、卡口蓋和螺口蓋。每種瓶蓋有其各自的優點。

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鉗口蓋
? ? ? ? 將隔墊擠壓在玻璃樣品瓶的瓶緣和折邊的鋁蓋之間。密封效果非常好，可有效防止樣品蒸發。自動進樣器的進樣針刺穿取樣時，隔墊的位置保持不變。對鉗口蓋樣品瓶進行封口時需要使用壓蓋器才能完成。對于少數樣品，手動壓蓋器是最好的選擇。對于大量樣品，可使用自動壓蓋器。

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螺口蓋
? ? ? ? 是通用的。擰緊瓶蓋會施加一個機械力，擠壓在玻璃瓶緣和鋁蓋之間的隔墊。在刺穿取樣過程中，螺口蓋的密封效果優異，通過機械方式頂住隔墊。組裝時不需要任何工具。

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卡口蓋

? ? ? ?是鉗口蓋密封方式的一種延伸。套在樣品瓶瓶緣上的塑料蓋通過將隔墊擠壓在玻璃與伸展的塑料蓋之間而形成密封。塑料蓋的張力是由于其試圖恢復自己原來的大小而產生的。該張力使玻璃、瓶蓋和隔墊之間形成密封。塑料卡口蓋無需任何工具就能蓋上。